1990'dan itibaren Tahran'a uçuşlarla yük taşıması yapan şirket, ağına Meşhed'i de katarak  ikinci İran destinasyonunu da açmış oldu. Yeni destinasyonu ile kargo kapasitesini artırmayı hedefleyen Emirates SkyCargo, uçak filosuyla 2014 yılında İran varışlı-çıkışlı 17.500 tondan fazla yükü taşıdı. Meşhed servisi ile İran ve BAE arasında haftalık 150 tonluk taşıma potansiyeli oluşturan Emirates SkyCargo'nun bu taşımaları arasında meyve-sebze, fındık, safran ve halı gibi İran'ın ihraç yükleri ile et, ilaç, medikal ekipmanlar, makine ve otomotiv yedek parçaları gibi ithal yükler de bulunuyor. Emirates SkyCargo'nun İran ihracat yüklerini taşıdığı ana destinasyonlar BAE, Kuveyt, Suudi Arabistan, Bahreyn, Japonya, Avustralya ve ABD olurken, İran varışlı ana ithalat destinasyonları BAE, Hong Kong, Güney Kore, Çin, Hindistan, Almanya ve İsviçre olarak gerçekleşiyor.